RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489406.1

UFD1-209, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 2

Gene UFD1, Length 994 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-209ENST00000489406 A0A0B4J269 797 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 F8VP50 259 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 NPC1O15118 1278 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PPFIA2O75334 1257 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 IGHV4-34P06331 123 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PNPLA4P41247 253 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 INHBCP55103 352 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ZNF234Q14588 700 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 C3orf38Q5JPI3 329 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 KCNB2Q92953 911 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 EPN3Q9H201 632 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CCSER2Q9H7U1 834 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SATB2Q9UPW6 733 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 DNM3Q9UQ16 869 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PLXNA2O75051 1894 aa15.95■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 OPA1O60313 960 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ITGB2P05107 769 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 LHX1P48742 406 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GEN1Q17RS7 908 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 HECTD3Q5T447 861 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 OR2T3Q8NH03 318 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 UCMAQ8WVF2 138 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PHF12Q96QT6 1004 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SYT15Q9BQS2 421 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CRTAC1Q9NQ79 661 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 KCNG1Q9UIX4 513 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SNX9Q9Y5X1 595 aa15.94■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 A0A1W2PPC4 97 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GABRDO14764 452 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SIGLEC6O43699 453 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CDKL5O76039 1030 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 OR52Z1P0C646 297 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 LMO2P25791 158 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ASIC1P78348 528 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 DAB2P98082 770 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SCARA3Q6AZY7 606 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 HTR3DQ70Z44 454 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 C8orf48Q96LL4 319 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.93■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 WNT9AO14904 365 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 ITGB3P05106 788 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GUCY2CP25092 1073 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 YWHAQP27348 245 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CD38P28907 300 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 FBXO32Q969P5 355 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SGF29Q96ES7 293 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 NACA2Q9H009 215 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 OSBPL2Q9H1P3 480 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 EBF2Q9HAK2 575 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 41.8
UFD1-209ENST00000489406 FBXO10Q9UK96 956 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CKAP5Q14008 2032 aa15.92■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 POLQO75417 2590 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 TRIM38O00635 465 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GREM1O60565 184 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 GJB6O95452 261 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PLCG1P19174 1290 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PSMA5P28066 241 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 RXRGP48443 463 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CACNA2D1P54289 1103 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 MFAP3P55082 362 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 NCKAP1LP55160 1127 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SOWAHAQ2M3V2 549 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PDZD8Q8NEN9 1154 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 P2RY11Q96G91 374 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PCED1BQ96HM7 432 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 TIPINQ9BVW5 301 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SGK2Q9HBY8 427 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CDH9Q9ULB4 789 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 MYH10P35580 1976 aa15.91■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 A0A1W2PR77 199 aa15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CYP26A1O43174 497 aa15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 SDC3O75056 442 aa15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PIGRP01833 764 aa15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 PDGFRBP09619 1106 aa15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
UFD1-209ENST00000489406 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms