RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BNIP1Q12981 228 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB6Q15916 424 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEC3Q8TD91 643 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAFAH2Q99487 392 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX25Q9H3E2 840 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDH9Q9HC56 1237 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C5orf42Q9H799 3197 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEA3O75764 348 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CBX6O95503 412 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YY1P25490 414 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCNKBP51801 687 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNA2D1P54289 1103 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC185Q8N715 623 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP3A43Q9HB55 503 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EURLQ9NYK6 297 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC17A7Q9P2U7 560 aa16.1■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALOX15BO15296 676 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD52P31358 61 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THPOP40225 353 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL4CP56559 192 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LILRA4P59901 499 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADIGQ0VDE8 80 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETDB1Q15047 1291 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP36Q96G28 342 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC25Q96NG3 672 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGAVP06756 1048 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NME3Q13232 169 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED10Q9BTT4 135 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.09■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K13O43283 966 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM155BO75949 473 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNA1P02708 482 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSH2P43246 934 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K7CLP57077 242 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPYSL3Q14195 570 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APPL2Q8NEU8 664 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC37BQ96QE4 947 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APBA2Q99767 749 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAG3Q9UGI9 489 aa16.08■□□□□ 0.17
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0G2JND7 137 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYB561D2O14569 222 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCF2LO15068 1137 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMHP03971 560 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT7P08729 469 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDC4P31431 198 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCNN1BP51168 640 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HDAC4P56524 1084 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GALNTL6Q49A17 601 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP6NLQ92738 828 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC17Q96AE7 1141 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EBF2Q9HAK2 575 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABGEF1Q9UJ41 708 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHKBQ9Y259 395 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP73A6NFT4 308 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGEA5O60502 916 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ABHD2P08910 425 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELK3P41970 407 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GBE1Q04446 702 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC38Q5VT99 294 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDIK1LQ8N165 341 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTN3Q9P232 1028 aa16.08■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHOC2Q9UQ13 582 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms