RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488421.1

ATG2B-204, Transcript of autophagy related 2B, humanhuman

TSL 4

Gene ATG2B, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2B-204ENST00000488421 SOAT2O75908 522 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 NXPH3O95157 252 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 A1BGP04217 495 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CYP2D6P10635 497 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CKMT1AP12532 417 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SATB1Q01826 763 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 VPS53Q5VIR6 699 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 LIN54Q6MZP7 749 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 USP17L6PQ6QN14 398 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 STT3BQ8TCJ2 826 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 AFG1LQ8WV93 481 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 EID2BQ96D98 161 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 GDF15Q99988 308 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 GPR35Q9HC97 309 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 GGA3Q9NZ52 723 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 DKK3Q9UBP4 350 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ITIH6Q6UXX5 1313 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 A6NLC8 198 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PRSS47A8MTI9 375 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TIMM44O43615 452 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ACTL6BO94805 426 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CHEK2O96017 543 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CD4P01730 458 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 EGR1P18146 543 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ITGALP20701 1170 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CPT1AP50416 773 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TRPC3Q13507 836 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ARHGEF7Q14155 803 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 INSCQ1MX18 579 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 FAM110CQ1W6H9 321 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PROSER3Q2NL68 480 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 MZT2BQ6NZ67 158 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 C4orf50Q6ZRC1 276 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SPPL3Q8TCT6 385 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TBC1D5Q92609 795 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 RILPL2Q969X0 211 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 MOGAT1Q96PD6 335 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 NRBP1Q9UHY1 535 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.89□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 A0A087WZ62 844 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 H7C4K7 107 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 SMIM22K7EJ46 135 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 QSOX1O00391 747 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 COQ9O75208 318 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 KIF20AO95235 890 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CYP2C9P11712 490 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 GYS1P13807 737 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 NPPBP16860 134 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 CD6P30203 668 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ATICP31939 592 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ADD2P35612 726 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 MMP13P45452 471 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 RXRGP48443 463 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 AP2B1P63010 937 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 FHL1Q13642 323 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 TOMM20Q15388 145 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PLA1AQ53H76 456 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 FAXCQ5TGI0 409 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa4.88□□□□□ -1.63
ATG2B-204ENST00000488421 PLAG1Q6DJT9 500 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms