RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 SDE2Q6IQ49 451 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 UNC13DQ70J99 1090 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF276Q8N554 614 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM174Q8WUU8 243 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FOXJ1Q92949 421 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BHMTQ93088 406 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 DHX58Q96C10 678 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CUEDC2Q9H467 287 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC39A2Q9NP94 309 aa15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP8B3O60423 1300 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 UBE4BO95155 1302 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GTW7 788 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NDUFS2O75306 463 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 STC2O76061 302 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 IGLV3-19P01714 112 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RARGP13631 454 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASPAP45381 313 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TPMTP51580 245 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 COPAP53621 1224 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MFAP3P55082 362 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZACNQ401N2 412 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMEM215Q68D42 235 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CADM4Q8NFZ8 388 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 GPR174Q9BXC1 333 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM49BQ9NUQ9 324 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.03■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CKAP5Q14008 2032 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MYH10P35580 1976 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 METTL12A8MUP2 240 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 SPTLC2O15270 562 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KLRC4O43908 158 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 EXOC3O60645 756 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PHACTR2O75167 634 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PPP6R2O75170 966 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF883P0CG24 379 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NCAM1P13591 858 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PLA2G4AP47712 749 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF11P52732 1056 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 BIRC3Q13489 604 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CAMK2BQ13554 666 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CUL4BQ13620 913 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 UNC93AQ86WB7 457 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 NACA2Q9H009 215 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 RAXQ9Y2V3 346 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 USP3Q9Y6I4 520 aa15.02■□□□□ -0
SDCCAG3-211ENST00000486441 MGAQ8IWI9 3026 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 CILPO75339 1184 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 GNSP15586 552 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADORA2BP29275 332 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 AP3M2P53677 418 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 AMPD3Q01432 767 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 INCA1Q0VD86 236 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 STK4Q13043 487 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 HLA-BQ31612 363 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 DCAF12L1Q5VU92 463 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 SV2AQ7L0J3 742 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 SLC9A9Q8IVB4 645 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 IQUBQ8NA54 791 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 GAREM1Q9H706 876 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 DKK4Q9UBT3 224 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.01□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 FAM200BP0CF97 657 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRKCHP24723 683 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 ZNF234Q14588 700 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 STK38Q15208 465 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIAA0895Q8NCT3 520 aa15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SDCCAG3-211ENST00000486441 SORCS1Q8WY21 1168 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms