RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SLC35C1Q96A29 364 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CEP295Q9C0D2 2601 aa22.63■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CD19P15391 556 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TKTL1P51854 596 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 NUCB2P80303 420 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 LRRC63Q05C16 580 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 PDE4CQ08493 712 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 RAB41Q5JT25 222 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 RAD54BQ9Y620 910 aa22.62■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 A0A1W2PQF6 199 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CISD3P0C7P0 127 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SLC8A3P57103 927 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SGO2Q562F6 1265 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ZNF276Q8N554 614 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 DEFB119Q8N690 84 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.61■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SLC12A8A0AV02 714 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 PSMA7O14818 248 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 BCAT1P54687 386 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 IRX4P78413 519 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 COG7P83436 770 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SDE2Q6IQ49 451 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 DENND1CQ8IV53 801 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 UBA3Q8TBC4 463 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TIGD1Q96MW7 591 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 HESX1Q9UBX0 185 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.6■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 KCNK5O95279 499 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ZBED1O96006 694 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 NDUFV2P19404 249 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ADIGQ0VDE8 80 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 STIM1Q13586 685 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TRIM61Q5EBN2 209 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 FYB2Q5VWT5 728 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP40-215ENST00000484528 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 UBR7Q8N806 425 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 DCLK3Q9C098 648 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CD93Q9NPY3 652 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.59■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 WASH3PC4AMC7 463 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 ITPKAP23677 461 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 FMO5P49326 533 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
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USP40-215ENST00000484528 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 EDEM1Q92611 657 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 GABRG3Q99928 467 aa22.58■■□□□ 1.21
USP40-215ENST00000484528 CD248Q9HCU0 757 aa22.58■■□□□ 1.21
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USP40-215ENST00000484528 O00370 1275 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 CHKAP35790 457 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 MFAP3P55082 362 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 GEN1Q17RS7 908 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 SYT12Q8IV01 421 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 KAT5Q92993 513 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 FBXO10Q9UK96 956 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 CKAP5Q14008 2032 aa22.57■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 USP24Q9UPU5 2620 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 PIK3R2O00459 728 aa22.56■■□□□ 1.2
USP40-215ENST00000484528 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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