RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	PRKCG	P05129	697 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ITGA5	P08648	1049 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	NPPB	P16860	134 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ADRA1D	P25100	572 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	NTSR1	P30989	418 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CCT5	P48643	541 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM38	O00635	465 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	EXOC3	O60645	756 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	WDR47	O94967	919 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PDE8B	O95263	885 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	AR	P10275	920 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FPR3	P25089	353 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RENBP	P51606	427 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DGKQ	P52824	942 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LMAN2	Q12907	356 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	BIRC3	Q13489	604 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PRKG1	Q13976	671 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	AOX1	Q06278	1338 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	NPHP1	O15259	732 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ASNA1	O43681	348 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	USP1	O94782	785 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	HSD3B1	P14060	373 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	HTR7	P34969	479 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DIO1	P49895	249 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PROK1	P58294	105 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TUBA4A	P68366	448 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PSG6	Q00889	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MASP2	O00187	686 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FCHO1	O14526	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	GCAT	O75600	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	MT-CO3	P00414	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA6	P08133	673 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	FHL3	Q13643	280 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ACOX1	Q15067	660 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CLK1-208	ENST00000464454	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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