RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464001.1

ITGB1-208, Transcript of integrin subunit beta 1, human

TSL 2

Gene ITGB1, Length 316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGB1-208	ENST00000464001	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	COL15A1	P39059	1388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITGB1-208	ENST00000464001	CA12	O43570	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MT-ND5	P03915	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ALPL	P05186	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MTX1	Q13505	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GPR162	Q16538	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001		B4DGG1	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TPP1	O14773	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CREB3	O43889	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	WDR47	O94967	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PLAU	P00749	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PEX2	P28328	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GALNS	P34059	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	THBS3	P49746	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DGKQ	P52824	942 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TBX4	P57082	545 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RHBDL3	P58872	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RALBP1	Q15311	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MMP21	Q8N119	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SNX22	Q96L94	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	YY1	P25490	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ACOX1	Q15067	660 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	RRH	O14718	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	TOMM40	O96008	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	HTR7	P34969	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MTAP	Q13126	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CNGA3	Q16281	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITGB1-208	ENST00000464001	PIGK	Q92643	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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