RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A7Q96T83 725 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SYT15Q9BQS2 421 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 EPN3Q9H201 632 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SPC25Q9HBM1 224 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 RGS18Q9NS28 235 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 FZD10Q9ULW2 581 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CFAP69A5D8W1 941 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 E7ENQ6 273 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf80F5H4A9 247 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 M0QZ92 97 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF10BO14763 440 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 GCATO75600 419 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO21O94952 628 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 CYP2F1P24903 491 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 MDH1BQ5I0G3 518 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CLLU1OSQ5K130 101 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 DEFB106AQ8N104 65 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4X1Q8N118 509 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM71DQ8N9W8 422 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 RSPH1Q8WYR4 309 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 IRGQQ8WZA9 623 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 UROC1Q96N76 676 aa5.87□□□□□ -1.47
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PTPRC-210ENST00000462363 ACBD6Q9BR61 282 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CALN1Q9BXU9 219 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ULBP1Q9BZM6 244 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 KRT82Q9NSB4 513 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-210ENST00000462363 PIGVQ9NUD9 493 aa5.87□□□□□ -1.47
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