RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453724.5

RPE-215, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 5

Gene RPE, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-215ENST00000453724 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 KXD1Q9BQD3 176 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 BRD9Q9H8M2 597 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 WNT16Q9UBV4 365 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CPQQ9Y646 472 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SCINQ9Y6U3 715 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CKAP5Q14008 2032 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.5□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 LEFTY2O00292 366 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MAN2B1O00754 1011 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 RTN2O75298 545 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ADH1CP00326 375 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 F9P00740 461 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 IGLV3-27P01718 113 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ERBB2P04626 1255 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ASGR2P07307 311 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CHRNB2P17787 502 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 GDI1P31150 447 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NOS2P35228 1153 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CHKAP35790 457 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MATKP42679 507 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 IFNAR2P48551 515 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NR1H3Q13133 447 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 E2F5Q15329 346 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 HGSNATQ68CP4 663 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 HTR3DQ70Z44 454 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MON1BQ7L1V2 547 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 TMC6Q7Z403 805 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 XYLT1Q86Y38 959 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 AZIN2Q96A70 460 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 PANX2Q96RD6 677 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SLC22A12Q96S37 553 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 RNF38Q9H0F5 515 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 DEF6Q9H4E7 631 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NMUR1Q9HB89 426 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 OSER1Q9NX31 292 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NUP205Q92621 2012 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CACNA1GO43497 2377 aa6.49□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 ARNTLO00327 626 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 IRAK2O43187 625 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 NRDCO43847 1150 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 GABBR2O75899 941 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 STC2O76061 302 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CALCAP01258 141 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 IGLV3-25P01717 112 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 APOEP02649 317 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CFHP08603 1231 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 AVPR2P30518 371 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 CCR1P32246 355 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 VIPR2P41587 438 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 MAGEA9P43362 315 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 SLC11A2P49281 568 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 AIF1P55008 147 aa6.48□□□□□ -1.37
RPE-215ENST00000453724 GSDMDP57764 484 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms