RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZBED1O96006 694 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 HMBSP08397 361 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 VDRP11473 427 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CD19P15391 556 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 FOXR2Q6PJQ5 311 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 LMO3Q8TAP4 145 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 UBA3Q8TBC4 463 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 ACOX2Q99424 681 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 MARCH2Q9P0N8 246 aa28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 O00370 1275 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 TM4SF5O14894 197 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 NTSR1P30989 418 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 MAP7D1Q3KQU3 841 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PKDCCQ504Y2 493 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 HESX1Q9UBX0 185 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 KIAA1257Q9ULG3 409 aa28.55■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 A0A1W2PQF6 199 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 BIN1O00499 593 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 WASP42768 502 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 DGKGP49619 791 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PPM1JQ5JR12 505 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 STPG1Q5TH74 334 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 FYB2Q5VWT5 728 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 TFAP2BQ92481 460 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 KAT5Q92993 513 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 NT5C1BQ96P26 610 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 DCLK3Q9C098 648 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CD248Q9HCU0 757 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.54■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 SLC12A8A0AV02 714 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 HOXB2P14652 356 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 GABRG2P18507 467 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 ADIGQ0VDE8 80 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 TMEM270Q6UE05 265 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.53■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 BICDL2A1A5D9 508 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PAEPP09466 180 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CHKAP35790 457 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 IL31Q6EBC2 164 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 DENND1CQ8IV53 801 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PGBD3Q8N328 593 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 SPACA7Q96KW9 195 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa28.52■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 CEP192Q8TEP8 1941 aa28.51■■■□□ 2.16
LMO1-202ENST00000428101 P4HA2O15460 535 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 SETSIPP0DME0 302 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 STX17P56962 302 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 KIAA1211LQ6NV74 962 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 CYP2U1Q7Z449 544 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 CHPFQ8IZ52 775 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 PPM1KQ8N3J5 372 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 GABRG3Q99928 467 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa28.51■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 YJEFN3A6XGL0 299 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 E7ENQ6 273 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 GABBR2O75899 941 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 PI4KAP42356 2102 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 LPCAT2Q7L5N7 544 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 FMNL3Q8IVF7 1028 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 TRIM59Q8IWR1 403 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 FAM217AQ8IXS0 508 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 TMEFF1Q8IYR6 380 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 PLD4Q96BZ4 506 aa28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 MAP3K13O43283 966 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 ADRB1P08588 477 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 MFAP3P55082 362 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 MARSP56192 900 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 CETN1Q12798 172 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 KCNH2Q12809 1159 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 PAK1Q13153 545 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 CNGA2Q16280 664 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 RNF43Q68DV7 783 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 SDE2Q6IQ49 451 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 RRAGAQ7L523 313 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 SCML4Q8N228 414 aa28.49■■■□□ 2.15
LMO1-202ENST00000428101 CPXM2Q8N436 756 aa28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms