RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG4CQ96DT6 458 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GANQ9H2C0 597 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 DPP3Q9NY33 737 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SPACA6W5XKT8 324 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PIPSLA2A3N6 862 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL10O95999 233 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB9P28065 219 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 VAC14Q08AM6 782 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM117BQ6P1L5 589 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 KAT2BQ92831 832 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 APBB2Q92870 758 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM79Q9BSE2 394 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP44Q9C0F1 390 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SESN1Q9Y6P5 492 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP9AO75110 1047 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3R1P27986 724 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CCT8P50990 548 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PTENP60484 403 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 IL5RAQ01344 420 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BMPR2Q13873 1038 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CSHL1Q14406 222 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CD302Q8IX05 232 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf60Q96EN9 201 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 HPSEQ9Y251 543 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 F8VZ95 297 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BQF6 201 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMTA2O94983 1202 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TPBGLP0DKB5 382 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP4Z1Q86W10 505 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 C19orf18Q8NEA5 215 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP10Q92851 521 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PARVBQ9HBI1 364 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH9Q9HC56 1237 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPN10Q9HC96 672 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 POLG2Q9UHN1 485 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CLOCKO15516 846 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAT1P54687 386 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCQQ04759 706 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAA1Q13131 559 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA9Q13797 1035 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MOXD1Q6UVY6 613 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TLK2Q86UE8 772 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TMC2Q8TDI7 906 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 USP18Q9UMW8 372 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PDZK1P1A8MUH7 402 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 F5H5T6 163 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PLA2G6O60733 806 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MED24O75448 989 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 MED26O95402 600 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GHRP10912 638 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 AMHR2Q16671 573 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 BDH2Q9BUT1 245 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 INTS13Q9NVM9 706 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 FCHO1O14526 889 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 ODC1P11926 461 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNA5P30532 468 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAPC2Q13487 334 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-202ENST00000426333 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms