RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FBXL6Q8N531 539 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 OR2W6PQ8NHA6 318 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CENPTQ96BT3 561 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PGBD4Q96DM1 585 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CENPHQ9H3R5 247 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 AAASQ9NRG9 546 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 KLK14Q9P0G3 267 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TJP2Q9UDY2 1190 aa10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 C5orf42Q9H799 3197 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CYB561D2O14569 222 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PTGESO14684 152 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 MCF2LO15068 1137 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SPTLC1O15269 473 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TBX10O75333 385 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FBXO21O94952 628 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CSPG5O95196 566 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TSHRP16473 764 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ZXDAP98168 799 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 MGAT3Q09327 533 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM15Q13444 863 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 KRT81Q14533 505 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 P3H1Q32P28 736 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FAM26DQ5JW98 314 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC31Q6UY01 552 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 STRADAQ7RTN6 431 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RFX6Q8HWS3 928 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SH2D3CQ8N5H7 860 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ACTL9Q8TC94 416 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 HAUS1Q96CS2 278 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CFAP57Q96MR6 1250 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF670Q9BS34 389 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 DUSP16Q9BY84 665 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CXCL16Q9H2A7 254 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FAM49BQ9NUQ9 324 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 KLHL11Q9NVR0 708 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.44□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ERICH4A6NGS2 130 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 H0Y858 1186 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SGK1O00141 431 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ALOX15BO15296 676 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CHRNA1P02708 482 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PDGFRBP09619 1106 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FGFR1P11362 822 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 MAGEA4P43358 317 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ID4P47928 161 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 NR2C2P49116 596 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RGS7P49802 495 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CDH6P55285 790 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SIGLEC14Q08ET2 396 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 GPS1Q13098 491 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 NR1H3Q13133 447 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 XRCC4Q13426 336 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 NOMO1Q15155 1222 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RASA2Q15283 850 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SMTNL2Q2TAL5 461 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 KCNT1Q5JUK3 1230 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ERMARDQ5T6L9 678 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CENPUQ71F23 418 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC25Q86WR0 208 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 SCUBE3Q8IX30 993 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FAM172AQ8WUF8 416 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 HSPH1Q92598 858 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 P3H4Q92791 437 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FAF2Q96CS3 445 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 UROC1Q96N76 676 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 RNF157Q96PX1 679 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 CALN1Q9BXU9 219 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 FAM107BQ9H098 131 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 EPN3Q9H201 632 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM7Q9H2U9 754 aa10.43□□□□□ -0.74
POLR1A-204ENST00000424089 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms