RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397611.7

PTPRD-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 8,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-205ENST00000397611 PRKAA2P54646 552 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 INCA1Q0VD86 236 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 STX3Q13277 289 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CHI3L2Q15782 390 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 IL31RAQ8NI17 732 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CPT1BQ92523 772 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FAM111AQ96PZ2 611 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 EDNRBP24530 442 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PSMA2P25787 234 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SOX11P35716 441 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FLOT2Q14254 428 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CCNYQ8ND76 341 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF670Q9BS34 389 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PXMP2Q9NR77 195 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 LSM1O15116 133 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MSCO60682 206 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ITGA9Q13797 1035 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TFDP1Q14186 410 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CGB2Q6NT52 195 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TRIM67Q6ZTA4 783 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SEPT1Q8WYJ6 367 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 HOXC10Q9NYD6 342 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 KPNA7A9QM74 516 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 NFIBO00712 420 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MTSS1O43312 755 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 KLHL2O95198 593 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 HADHAP40939 763 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PTPN9P43378 593 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 COPAP53621 1224 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PRKCEQ02156 737 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 REPS2Q8NFH8 660 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SLC9A7Q96T83 725 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SOX13Q9UN79 622 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CLEC11AQ9Y240 323 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 RAG1P15918 1043 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CHKAP35790 457 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 GJA8P48165 433 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SNAP25P60880 206 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CTC1Q2NKJ3 1217 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 DNAAF3Q8N9W5 541 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FLCNQ8NFG4 579 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MSTO1Q9BUK6 570 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 BRD8Q9H0E9 1235 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 C10orf88Q9H8K7 445 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PKD2L2Q9NZM6 624 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 COL20A1Q9P218 1284 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TNFSF13BQ9Y275 285 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 VWA5AO00534 786 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FAM189A1O60320 539 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 PGM3O95394 542 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 KRT4P19013 534 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 TNFAIP2Q03169 654 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SH2D5Q6ZV89 423 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 KLC2Q9H0B6 622 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FZD8Q9H461 694 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 GALNT8Q9NY28 637 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CST8O60676 142 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 MAFO75444 373 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 OATP04181 439 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 CREB1P16220 341 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 BGNP21810 368 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRD-205ENST00000397611 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
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