RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARL13BQ3SXY8 428 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC181Q5TID7 509 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 PIP4P1Q86T03 277 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 OR2C3Q8N628 320 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 VPS16Q9H269 839 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 RGL1Q9NZL6 768 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 RNF7Q9UBF6 113 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-790P-201ENST00000384479 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FYB1O15117 783 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TLR2O60603 784 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP12O75317 370 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 VIPP01282 170 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYL1P05976 194 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TNFSF4P23510 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PBX1P40424 430 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 JAK3P52333 1124 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 AK2P54819 239 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBX4P57082 545 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RPS13P62277 151 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GHRHRQ02643 423 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC14A1Q13336 389 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM209BQ5JX69 171 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GLMPQ8WWB7 406 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBCBQ99426 244 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNAB3O43448 404 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CA12O43570 354 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRC1O43663 620 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NTSR2O95665 410 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTSAP10619 480 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TACR3P29371 465 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 GALNSP34059 522 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 HOXD12P35452 270 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NR4A2P43354 598 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MMP13P45452 471 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PMS2P11Q13670 270 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ETFDHQ16134 617 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ACSM6Q6P461 480 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 CUL5Q93034 780 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRRC46Q96FV0 321 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 FCRL4Q96PJ5 515 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 STK33Q9BYT3 514 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 NUAK2Q9H093 628 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-790P-201ENST00000384479 USP29Q9HBJ7 922 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms