RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT35Q92764 455 aa7.04□□□□□ -1.28
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RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 USP29Q9HBJ7 922 aa7.04□□□□□ -1.28
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