RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 HCSTQ9UBK5 93 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PTPRDP23468 1912 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SCN5AQ14524 2016 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 H7C0C1 242 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ATP5OP48047 213 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SLC5A3P53794 718 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 BEND5Q7L4P6 421 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PCGF5Q86SE9 256 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CEP57Q86XR8 500 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ADAM32Q8TC27 787 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 EDEM1Q92611 657 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 NTAN1Q96AB6 310 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 TBX21Q9UL17 535 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 F9P00740 461 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 GOT1P17174 413 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FGFR3P22607 806 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 NR2C2P49116 596 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CTXN3Q4LDR2 81 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 EFHC2Q5JST6 749 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 RELL1Q8IUW5 271 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PWWP2AQ96N64 755 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 DDIT4Q9NX09 232 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 OR6C75A6NL08 312 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 GALTP07902 379 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ADRA1BP35368 520 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SCAPQ12770 1279 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF280DQ6N043 979 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CFAP69A5D8W1 941 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 H3BRJ5 948 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SHBGP04278 402 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FUT10Q6P4F1 479 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 VSTM1Q6UX27 236 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 LRRC43Q8N309 656 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 RNF139Q8WU17 664 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 USP29Q9HBJ7 922 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PATJQ8NI35 1801 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 AMPD1P23109 780 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 GBE1Q04446 702 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 EXOC4Q96A65 974 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 RTP4Q96DX8 246 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1B-201ENST00000380750 XRCC4Q13426 336 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 IKBKEQ14164 716 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 KRT71Q3SY84 523 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 KCTD16Q68DU8 428 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 C8orf48Q96LL4 319 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM66O15016 1216 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 TTC4O95801 387 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 MAGEA11P43364 429 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 CXCR3P49682 368 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 CPT1BQ92523 772 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 B3GALT6Q96L58 329 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 PBX3P40426 434 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 TAC4Q86UU9 113 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 HOOK3Q86VS8 718 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1B-201ENST00000380750 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms