RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 PQLC3Q8N755 202 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM111AQ96PZ2 611 aa24.77■■□□□ 1.56
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TFDP2Q14188 446 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 HIC1Q14526 733 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT81Q14533 505 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CA9Q16790 459 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM47CQ5HY64 1035 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PLD5Q8N7P1 536 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPN18Q99952 460 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTN3Q9P232 1028 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 KLF11O14901 512 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FAAP100Q0VG06 881 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 NOTUMQ6P988 496 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 BEST2Q8NFU1 509 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 OR6B3Q8NGW1 331 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 USP29Q9HBJ7 922 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.76■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 UNCXA6NJT0 531 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 KBTBD13C9JR72 458 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 RECQL4O94761 1208 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 AKAP5P24588 427 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SDC4P31431 198 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MUM1Q2TAK8 710 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 BOLA3Q53S33 107 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM91A1Q658Y4 838 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC17Q96AE7 1141 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 H7C0C1 242 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 NVLO15381 856 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 LINGO3P0C6S8 592 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SETSIPP0DME0 302 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PYGBP11216 843 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 NEFHP12036 1026 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 BGNP21810 368 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 VHLP40337 213 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP5OP48047 213 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CBLBQ13191 982 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ11Q14654 390 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PDK2Q15119 407 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PCDH19Q8TAB3 1148 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MCUR1Q96AQ8 359 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 APOL6Q9BWW8 343 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 HESX1Q9UBX0 185 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 HDAC4P56524 1084 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC6Q16204 474 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SESTD1Q86VW0 696 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP7D3Q8IWC1 876 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF333Q96JL9 665 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.74■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 A6NJR5 290 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K6O95382 1288 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 F2P00734 622 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP2C9P11712 490 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 SERPINB4P48594 390 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS52Q8N1B4 723 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 C7orf31Q8N865 590 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 TEKT4Q8WW24 435 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 USP6NLQ92738 828 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 NMRK1Q9NWW6 199 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 NRCAMQ92823 1304 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 A8MXQ7 604 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 CHADO15335 359 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM155BO75949 473 aa24.73■■□□□ 1.55
AMIGO1-201ENST00000369862 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms