RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF479Q96JC4 524 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 MEIS3Q99687 375 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 DECR2Q9NUI1 292 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 DKK4Q9UBT3 224 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 USP19O94966 1318 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CAPN8A6NHC0 703 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFB8O95169 186 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 COPAP53621 1224 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ITGA8P53708 1063 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 MZT2AQ6P582 158 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PDXDC1Q6P996 788 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 STK31Q9BXU1 1019 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 COL15A1P39059 1388 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RBL1P28749 1068 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 CDC25AP30304 524 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 STK3Q13188 491 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 INMTO95050 263 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RFPL1O75677 317 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM225BP0DP42 221 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 PLA2G2AP14555 144 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 HOXB2P14652 356 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 IL1R1P14778 569 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 TFEBP19484 476 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRK-202ENST00000368205 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 USP43Q70EL4 1123 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 TPH2Q8IWU9 490 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 ASB5Q8WWX0 329 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-202ENST00000368205 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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