RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUL1Q969V5 352 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM41AQ96HV5 264 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 C5orf34Q96MH7 638 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FSCN3Q9NQT6 498 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FLRT1Q9NZU1 646 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEMA5BQ9P283 1151 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 AQP12BA6NM10 295 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 J3KTA2 159 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 M0QZQ0 153 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAF5LO75529 589 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP1O94782 785 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NTSR2O95665 410 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CELA2AP08217 269 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPGP29372 298 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHBDL3P58872 404 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAE1P78406 368 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC14A1Q13336 389 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 BFSP2Q13515 415 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNB1Q14721 858 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 STARD3Q14849 445 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEC23BQ15437 767 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLDC1Q6P9B6 456 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPICE1Q8N0Z3 855 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM71DQ8N9W8 422 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 HS6ST2Q96MM7 605 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT22Q9BRQ3 303 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFHD1Q9BUP0 239 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPS8L2Q9H6S3 715 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDGFCQ9NRA1 345 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RXFP3Q9NSD7 469 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAGLN3Q9UI15 199 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CA14Q9ULX7 337 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 VPS4AQ9UN37 437 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCSK5Q92824 1860 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A087WV62 115 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC187A0A096LP49 1063 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 C16orf96A6NNT2 1141 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM232C9JQI7 657 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP6CO00743 305 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TUBB4AP04350 444 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANXA6P08133 673 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALADP13716 330 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPPBP16860 134 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPHB2P29323 1055 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSTM5P46439 218 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 JAK3P52333 1124 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFAIP2Q03169 654 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEMA3BQ13214 749 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAB1Q13480 694 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRM4Q14833 912 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 BRD3Q15059 726 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 C4orf46Q504U0 113 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 MSANTD2Q6P1R3 559 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GGT6Q6P531 493 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 RANBP10Q6VN20 620 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF398Q8TD17 642 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 STYXQ8WUJ0 223 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 VOPP1Q96AW1 172 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRB3Q9BUF7 120 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRE3Q9BY15 652 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 HELLSQ9NRZ9 838 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR17Q8IZU2 1322 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GXYLT2A0PJZ3 443 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 LGALS16A8MUM7 142 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPC1O15118 1278 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 FFAR2O15552 330 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASNA1O43681 348 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms