RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ALADP13716 330 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAF2Q12933 501 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SPIDRQ14159 915 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GREM2Q9H772 168 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MYL12BO14950 172 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC17Q8N6Y2 441 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6B3Q8NGW1 331 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 WEE2P0C1S8 567 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BNIP2Q12982 314 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF3C4Q9UKN8 822 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MROH2AA6NES4 1674 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PTENP60484 403 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NME3Q13232 169 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RDM1Q8NG50 284 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CHID1Q9BWS9 393 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RPS6KA6Q9UK32 745 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ITGA2P17301 1181 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CCR3P51677 355 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DOK7Q18PE1 504 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNEQ86WN2 208 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LEMD2Q8NC56 503 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SUN5Q8TC36 379 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ALG6Q9Y672 507 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BBOX1O75936 387 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CBX6O95503 412 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LDLRP01130 860 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COMTP21964 271 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 XKRXQ6PP77 449 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MREGQ8N565 214 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 VCPIP1Q96JH7 1222 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COX4I2Q96KJ9 171 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GRM4Q14833 912 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NEDD8Q15843 81 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AHSPQ9NZD4 102 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SUPT3HB4E1H0 165 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX3O60493 162 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AKR1B1P15121 316 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GP5P40197 560 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 QPRTQ15274 297 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF220Q5VTB9 566 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CREG2Q8IUH2 290 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMC5P62195 406 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ARCQ7LC44 396 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EXD1Q8NHP7 514 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EMSYQ7Z589 1322 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 QARSP47897 775 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FMO5P49326 533 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL26P61254 145 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CSNK2BP67870 215 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKHQ9HCJ1 492 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM49D1C9J1S8 452 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKAB2O43741 272 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 VAV1P15498 845 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CRABP2P29373 138 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PNPLA4P41247 253 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH18Q13634 790 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC15A2Q16348 729 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A0X1KG70 313 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL33A6NCF5 533 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CD4P01730 458 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NUAK2Q9H093 628 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms