RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MYOZ2Q9NPC6 264 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 NBPF26B4DH59 902 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PPP2R1BP30154 601 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HSD17B3P37058 310 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ARSEP51690 589 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PTH1RQ03431 593 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 PLD1Q13393 1074 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HERC3Q15034 1050 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 E2F4Q16254 413 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SV2CQ496J9 727 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TRIQKQ629K1 86 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 COLGALT2Q8IYK4 626 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TC2NQ8N9U0 490 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DPP7Q9UHL4 492 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf18Q9UK00 162 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GDAQ9Y2T3 454 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TTC26A0AVF1 554 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 HEATR9A2RTY3 570 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 E5RI56 91 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 F8VZ95 297 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MSL3P1P0C860 447 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 RPA1P27694 616 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ALDH9A1P49189 494 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 C21orf59P57076 290 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 RBP5P82980 135 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 ALLCQ8N6M5 410 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ARRDC4Q8NCT1 418 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FNIP2Q9P278 1114 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL11O14625 94 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CHST10O43529 356 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 GIN1Q9NXP7 522 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 POLIQ9UNA4 740 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 SALL1Q9NSC2 1324 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DPYSL4O14531 572 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRD-201ENST00000355233 SNX7Q9UNH6 387 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 ISPDA4D126 451 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DFNA5O60443 496 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 TPBGLP0DKB5 382 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 MLNP12872 115 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 GP5P40197 560 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRD-201ENST00000355233 Q4G0T1 1027 aa5.05□□□□□ -1.6
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