RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM62Q9BVG3 475 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 HCSTQ9UBK5 93 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PTPRDP23468 1912 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SCN5AQ14524 2016 aa25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 H7C0C1 242 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ATP5OP48047 213 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SLC5A3P53794 718 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 BEND5Q7L4P6 421 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PCGF5Q86SE9 256 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CEP57Q86XR8 500 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ADAM32Q8TC27 787 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 EDEM1Q92611 657 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 NTAN1Q96AB6 310 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 TBX21Q9UL17 535 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 F9P00740 461 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 GOT1P17174 413 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FGFR3P22607 806 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 NR2C2P49116 596 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CTXN3Q4LDR2 81 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 EFHC2Q5JST6 749 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CEP128Q6ZU80 1094 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 RELL1Q8IUW5 271 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PWWP2AQ96N64 755 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 DDIT4Q9NX09 232 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.23■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 OR6C75A6NL08 312 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 GALTP07902 379 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ADRA1BP35368 520 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SCAPQ12770 1279 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF280DQ6N043 979 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.22■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CFAP69A5D8W1 941 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 H3BRJ5 948 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SHBGP04278 402 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FUT10Q6P4F1 479 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 VSTM1Q6UX27 236 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC43Q8N309 656 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 RNF139Q8WU17 664 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 USP29Q9HBJ7 922 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PATJQ8NI35 1801 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 AMPD1P23109 780 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 GBE1Q04446 702 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 SCN4BQ8IWT1 228 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 EXOC4Q96A65 974 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 RTP4Q96DX8 246 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.21■■□□□ 1.63
SERF1A-202ENST00000354833 XRCC4Q13426 336 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 IKBKEQ14164 716 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 KRT71Q3SY84 523 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 KCTD16Q68DU8 428 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 C8orf48Q96LL4 319 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.2■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM66O15016 1216 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 TTC4O95801 387 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 MAGEA11P43364 429 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 CXCR3P49682 368 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 CPT1BQ92523 772 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 B3GALT6Q96L58 329 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 PBX3P40426 434 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 TAC4Q86UU9 113 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 HOOK3Q86VS8 718 aa25.19■■□□□ 1.62
SERF1A-202ENST00000354833 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms