RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 ETNK2Q9NVF9 386 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 USP3Q9Y6I4 520 aa18.58■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ERICH4A6NGS2 130 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NCAM1P13591 858 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RBL1P28749 1068 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PPIL6Q8IXY8 311 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SHOC2Q9UQ13 582 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.57■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.57■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PGM2Q96G03 612 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ANLNQ9NQW6 1124 aa18.57■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PATJQ8NI35 1801 aa18.56■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.56■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SCLYQ96I15 445 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RNF208Q9H0X6 261 aa18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NDC80O14777 642 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TADA2AO75478 443 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 AMHP03971 560 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CCL5P13501 91 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 BASP1P80723 227 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 GUCY1A3Q02108 690 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FNBP1LQ5T0N5 605 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CEP128Q6ZU80 1094 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SEPT8Q92599 483 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CASD1Q96PB1 797 aa18.55■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 ADRA1BP35368 520 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PPP2R2AP63151 447 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ABI1Q8IZP0 508 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 NETO2Q8NC67 525 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RNF139Q8WU17 664 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 IRGQQ8WZA9 623 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ARHGEF4Q9NR80 690 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 HCSTQ9UBK5 93 aa18.55■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 OGDHLQ9ULD0 1010 aa18.55■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 I6L893 689 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
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ACTB-201ENST00000331789 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 MSS51Q4VC12 460 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 EFHC2Q5JST6 749 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CENPUQ71F23 418 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CROCCP2Q86T23 111 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 RTP4Q96DX8 246 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 DDIT4Q9NX09 232 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.562e-18■□□□□ 10.5
ACTB-201ENST00000331789 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.54■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CFAP69A5D8W1 941 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 FAM72CH0Y354 149 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 H3BRJ5 948 aa18.53■□□□□ 0.56
ACTB-201ENST00000331789 CCL23P55773 120 aa18.53■□□□□ 0.56
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