RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329117.9

BCAN-201, Transcript of brevican, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCAN, Length 3,466 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAN-201ENST00000329117 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 MMRN1Q13201 1228 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TAF5Q15542 800 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NADK2Q4G0N4 442 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 FAM209AQ5JX71 171 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ZBTB33Q86T24 672 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 BSNDQ8WZ55 320 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ACSS2Q9NR19 701 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 A0A088AWK7 358 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 KRT3P12035 628 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 DPYSL3Q14195 570 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 MTERF2Q49AM1 385 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SIAEQ9HAT2 523 aa14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TMEM191CA6NGB0 347 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 BBOX1O75936 387 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 KRT19P08727 400 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ALDH1A3P47895 512 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ROR1Q01973 937 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PTP4A2Q12974 167 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NXNQ6DKJ4 435 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ZNF677Q86XU0 584 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PGBD4Q96DM1 585 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 RIT2Q99578 217 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 COA1Q9GZY4 146 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PLLPQ9Y342 182 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NOTOA8MTQ0 251 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NDC80O14777 642 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SERPINB5P36952 375 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ETV4P43268 484 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 CDH6P55285 790 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 OSTNP61366 133 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 RELAQ04206 551 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 INAQ16352 499 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 KLHDC10Q6PID8 442 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 CHSY1Q86X52 802 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 PNPOQ9NVS9 261 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 ITGB4P16144 1822 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NFIBO00712 420 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 GRAP2O75791 330 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 CALB1P05937 261 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 MAP3K10Q02779 954 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 KRT81Q14533 505 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 OSTM1Q86WC4 334 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 STKLD1Q8NE28 680 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TMC2Q8TDI7 906 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 AZIN2Q96A70 460 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 STRA6Q9BX79 667 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.65□□□□□ -0.06
BCAN-201ENST00000329117 TEX28O15482 410 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 ADCY6O43306 1168 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 ITM2AO43736 263 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 PKNOX1P55347 436 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 GK3PQ14409 553 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.64□□□□□ -0.07
BCAN-201ENST00000329117 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms