RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328333.12

COL7A1-201, Transcript of collagen type VII alpha 1 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL7A1, Length 9,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL7A1-201ENST00000328333 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 USP17L5A8MUK1 530 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 DPYSL4O14531 572 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ALADP13716 330 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 DGKDQ16760 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TNFRSF21O75509 655 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 GRK4P32298 578 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TEX46H3BTG2 121 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MDM4O15151 490 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SEC24AO95486 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CYP2C9P11712 490 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CPA2P48052 419 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NEDD8Q15843 81 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PRKD2Q9BZL6 878 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MUC13Q9H3R2 512 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CRTAMO95727 393 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PDHBP11177 359 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 FCER1AP12319 257 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 C3orf18Q9UK00 162 aa14.66□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ACADLP28330 430 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TTC23Q5W5X9 447 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CPNE1Q99829 537 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 A0A0X1KG70 313 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ENPEPQ07075 957 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NAGPAQ9UK23 515 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 USP17L8P0C7I0 530 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SPON2Q9BUD6 331 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CST8O60676 142 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 LCP1P13796 627 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ATF6P18850 670 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ARHGDIBP52566 201 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 HSF2Q03933 536 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 FUKQ8N0W3 1084 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SGF29Q96ES7 293 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 F9P00740 461 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ST8SIA6P61647 398 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ZSWIM7Q19AV6 140 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SV2CQ496J9 727 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 AIFM3Q96NN9 605 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 APOL5Q9BWW9 433 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ACOT9Q9Y305 439 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TPST1O60507 370 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SLC26A3P40879 764 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 SFRP1Q8N474 314 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 ARPP19P56211 112 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 PJA1Q8NG27 643 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.65□□□□□ -0.06
COL7A1-201ENST00000328333 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ARPC4P59998 168 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 TUBA1BP68363 451 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 SLC15A2Q16348 729 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ZNF284Q2VY69 593 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 TUBA1AQ71U36 451 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 CDH9Q9ULB4 789 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 PLK4O00444 970 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 MGRN1O60291 552 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ERFP50548 548 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ITGADQ13349 1161 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ANKS6Q68DC2 871 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
COL7A1-201ENST00000328333 MUC3BQ9H195 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms