RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 NEFHP12036 1026 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 L1CAMP32004 1257 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 SLC18A2Q05940 514 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TEKT4Q8WW24 435 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 KLC2Q9H0B6 622 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 EBF2Q9HAK2 575 aa16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SHQ1-201ENST00000325599 COL1A2P08123 1366 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 EPHB2P29323 1055 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 STILQ15468 1287 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SESTD1Q86VW0 696 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC185Q8N715 623 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SNX27Q96L92 541 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 OSMRQ99650 979 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 MECRQ9BV79 373 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 KLK14Q9P0G3 267 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SNAPC2Q13487 334 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB6Q15916 424 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF534Q76KX8 674 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TTC39CQ8N584 583 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTS10Q9H324 1103 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 KCNK13Q9HB14 408 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 MDM4O15151 490 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 COQ9O75208 318 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 MMP3P08254 477 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CCND1P24385 295 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 LONP2Q86WA8 852 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TBCBQ99426 244 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF670Q9BS34 389 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 HEY2Q9UBP5 337 aa16.95■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SPTLC1O15269 473 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ATP5HO75947 161 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CSH1P0DML2 217 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CSH2P0DML3 217 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 KCNT2Q6UVM3 1135 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF570Q96NI8 536 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CNTN3Q9P232 1028 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PDHXO00330 501 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 DIAPH2O60879 1101 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 GM2AP17900 193 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 AMPD1P23109 780 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINB4P48594 390 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 FAM13CQ8NE31 585 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.94■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GVG6 124 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CFAP69A5D8W1 941 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 COPEO14579 308 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SPAG6O75602 509 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 RECQL4O94761 1208 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 GNAT1P11488 350 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 PARP6Q2NL67 630 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF410Q86VK4 478 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 A6NJR5 290 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 CYB561D2O14569 222 aa16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINB3P29508 390 aa16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms