RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.96■□□□□ 0.31
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CHTF18-202ENST00000317063 HSF2BPO75031 334 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 CA8P35219 290 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 WDR93Q6P2C0 686 aa16.94■□□□□ 0.3
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CHTF18-202ENST00000317063 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC185Q8N715 623 aa16.94■□□□□ 0.3
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CHTF18-202ENST00000317063 WDR27A2RRH5 827 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 MTMR11A4FU01 709 aa16.94■□□□□ 0.3
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CHTF18-202ENST00000317063 M0QYT0 321 aa16.94■□□□□ 0.3
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CHTF18-202ENST00000317063 TTI1O43156 1089 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 TBC1D4O60343 1298 aa16.94■□□□□ 0.3
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CHTF18-202ENST00000317063 ITIH3Q06033 890 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 26.8
CHTF18-202ENST00000317063 PSMD5Q16401 504 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 GIPC2Q8TF65 315 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 DPF3Q92784 378 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.94■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 FSCN2O14926 492 aa16.93■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 KDELR1P24390 212 aa16.93■□□□□ 0.3
CHTF18-202ENST00000317063 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.93■□□□□ 0.3
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