RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 T-ENOLP0DO92 83 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SERPINB4P48594 390 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 GRB14Q14449 540 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 FAXCQ5TGI0 409 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TINF2Q9BSI4 451 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 KAT6AQ92794 2004 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 KPNA7A9QM74 516 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC6O75061 913 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN4P29074 926 aa20.25■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 GTF2A2P52657 109 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ARFIP2P53365 341 aa20.25■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 TNIP3Q96KP6 325 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.25■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRN2Q92932 1015 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 PLLPQ9Y342 182 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 FAM159BA6NKW6 160 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MLNP12872 115 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 LCP1P13796 627 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 APPL2Q8NEU8 664 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MATKP42679 507 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TAF6P49848 677 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SLC8A3P57103 927 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SV2CQ496J9 727 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ATG16L1Q676U5 607 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 OSMRQ99650 979 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 TLE6Q9H808 572 aa20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0G2JND7 137 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 A8MUI8 341 aa20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-201ENST00000311008 I3L4J1 428 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K6O95382 1288 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 PDGFRBP09619 1106 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 OVGP1Q12889 678 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 XKR4Q5GH76 650 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF534Q76KX8 674 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 PLAC1Q9HBJ0 212 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 DTLQ9NZJ0 730 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-201ENST00000311008 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.23■□□□□ 0.83
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