RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CHFRQ96EP1 664 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 HPS4Q9NQG7 708 aa9.49□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 COX16Q9P0S2 106 aa9.49□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 KRBA1A5PL33 1030 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 CHADO15335 359 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 IGLV3-27P01718 113 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 CALB1P05937 261 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 KRT3P12035 628 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC39A13Q96H72 371 aa9.48□□□□□ -0.89
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PDE4D-201ENST00000309641 CA14Q9ULX7 337 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 TFR2Q9UP52 801 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 COL4A2P08572 1712 aa9.48□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 E2F8A0AVK6 867 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 M0QYT0 321 aa9.47□□□□□ -0.89
PDE4D-201ENST00000309641 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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