RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SCLYQ96I15 445 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SAYSD1Q9NPB0 183 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.63■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PITPNM1O00562 1244 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 KCNN4O15554 427 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 COL6A1P12109 1028 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PPIL6Q8IXY8 311 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SCAMP5Q8TAC9 235 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ANLNQ9NQW6 1124 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TADA2AO75478 443 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CCL5P13501 91 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ARL4AP40617 200 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PPARDQ03181 441 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 LONRF1Q17RB8 773 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SEPT8Q92599 483 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 HCSTQ9UBK5 93 aa23.62■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 EMC10Q5UCC4 262 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TLCD1Q96CP7 247 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PGM2Q96G03 612 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CASD1Q96PB1 797 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RASGRF2O14827 1237 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 OAZ2O95190 189 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 AMHP03971 560 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 DDIT4Q9NX09 232 aa23.61■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 I6L893 689 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 NDC80O14777 642 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 GRIK1P39086 918 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CCL23P55773 120 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RNF139Q8WU17 664 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 IRGQQ8WZA9 623 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.6■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CREB3O43889 395 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 BANF1O75531 89 aa23.59■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 EFHC2Q5JST6 749 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 DTLQ9NZJ0 730 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TRAPPC3O43617 180 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ADRA1BP35368 520 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 GNGT1P63211 74 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 AUHQ13825 339 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 RTP4Q96DX8 246 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A7Q96T83 725 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 NR2C2P49116 596 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 IRAK1P51617 712 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 SLC5A3P53794 718 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 GUCY1A3Q02108 690 aa23.58■■□□□ 1.37
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VSTM4-201ENST00000298454 HIF1AQ16665 826 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 FNBP1LQ5T0N5 605 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CENPUQ71F23 418 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 CEP57Q86XR8 500 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ZBED8Q8IZ13 594 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM28Q9UKQ2 775 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 TET1Q8NFU7 2136 aa23.58■■□□□ 1.37
VSTM4-201ENST00000298454 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FAM72CH0Y354 149 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 MTM1Q13496 603 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.58■■□□□ 1.36
VSTM4-201ENST00000298454 FAM72AQ5TYM5 149 aa23.58■■□□□ 1.36
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