RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G4AP47712 749 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 E2F1Q01094 437 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PKDCCQ504Y2 493 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 HES3Q5TGS1 186 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MIB1Q86YT6 1006 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GPD1LQ8N335 351 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA1Q92805 767 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLK3Q9C098 648 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LHX5Q9H2C1 402 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SGK2Q9HBY8 427 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CD248Q9HCU0 757 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS13Q9NVM9 706 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GMIPQ9P107 970 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPR1Q14643 2758 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMA5O15230 3695 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEC1O60732 1142 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GCNT3O95395 438 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA4FO95754 770 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GLDCP23378 1020 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TXLNAP40222 546 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CSRP3P50461 194 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A3P53794 718 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TLE3Q04726 772 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN1Q05586 938 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNH2Q12809 1159 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC3Q13507 836 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MCTP1Q6DN14 999 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM124AQ86V42 546 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SKAP1Q86WV1 359 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR49Q8IV35 697 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T3Q8NH03 318 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD54LQ92698 747 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SAAL1Q96ER3 474 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A11Q9BYW1 496 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM117AQ9C073 453 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CIPCQ9C0C6 399 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GDF3Q9NR23 364 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SCML1Q9UN30 329 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GTQ1 180 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNJ18B7U540 433 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 WASH3PC4AMC7 463 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y8X5 98 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 VILLO15195 856 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BRINP1O60477 761 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FSBPO95073 299 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 RALAP11233 206 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 P4HA1P13674 534 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNI1P19237 187 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ADSSP30520 456 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 ATICP31939 592 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DDIT3P35638 169 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSKP43235 329 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 COG7P83436 770 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM6Q14566 821 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 IL17AQ16552 155 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.29□□□□□ -1.08
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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