RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 EFHC2Q5JST6 749 aa15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 PPIL6Q8IXY8 311 aa15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ERICH4A6NGS2 130 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 RBL1P28749 1068 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 MAGEA4P43358 317 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 GBE1Q04446 702 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 AGBL2Q5U5Z8 902 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 SCAMP5Q8TAC9 235 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 FAF2Q96CS3 445 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 PKMYT1Q99640 499 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 HIPK3Q9H422 1215 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ALDH2P05091 517 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 C6orf118Q5T5N4 469 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 CROCCP2Q86T23 111 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 RNF34Q969K3 372 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.16■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ZNF487B1APH4 448 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 LONRF1Q17RB8 773 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 CENPUQ71F23 418 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 CPT1BQ92523 772 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 H3BRJ5 948 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ZBED8Q8IZ13 594 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 RNF139Q8WU17 664 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 APBB2Q92870 758 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ETNK2Q9NVF9 386 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 ADAM28Q9UKQ2 775 aa15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
NICN1-201ENST00000273598 CFAP69A5D8W1 941 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 OAZ2O95190 189 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 ADRA1BP35368 520 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 ARPP19P56211 112 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 GNGT1P63211 74 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 MTM1Q13496 603 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 HIF1AQ16665 826 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 CTXN3Q4LDR2 81 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 KDM7AQ6ZMT4 941 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 IRGQQ8WZA9 623 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 CASD1Q96PB1 797 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 PGLYRP2Q96PD5 576 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 WDCPQ9H6R7 721 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 USP29Q9HBJ7 922 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 RRN3Q9NYV6 651 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 F9P00740 461 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 NR2C2P49116 596 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 SLC5A3P53794 718 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 TET1Q8NFU7 2136 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 B3GALT6Q96L58 329 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 CCDC77Q9BR77 488 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 RAB6BQ9NRW1 208 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 HCSTQ9UBK5 93 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 UPP2O95045 317 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 ARL4CP56559 192 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 GAD2Q05329 585 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 DMTNQ08495 405 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 TCTN1Q2MV58 587 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 KCNT2Q6UVM3 1135 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 BNIPLQ7Z465 357 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.13■□□□□ 0.01
NICN1-201ENST00000273598 SLC9A7Q96T83 725 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms