RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 PIF1Q9H611 641 aa15.52■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.52■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 RABGEF1Q9UJ41 708 aa15.52■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.52■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 OR6B1O95007 311 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DLG1Q12959 904 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TMEM63BQ5T3F8 832 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ZNF302Q9NR11 478 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CISHQ9NSE2 258 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CDH22Q9UJ99 828 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ADRB2P07550 413 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FASP25445 335 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CNTFP26441 200 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ETFBP38117 255 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PDK1Q15118 436 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 BRINP3Q76B58 766 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FAM47BQ8NA70 645 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ZBTB18Q99592 522 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SEPHS2Q99611 448 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 RNF146Q9NTX7 359 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CRADDP78560 199 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 WASHC5Q12768 1159 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ITPK1Q13572 414 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ARL13BQ3SXY8 428 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 EFHC2Q5JST6 749 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DHFR2Q86XF0 187 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FEM1BQ9UK73 627 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TSPOAP1O95153 1857 aa15.51■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 WDR27A2RRH5 827 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SUPT7LO94864 414 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ASNSP08243 561 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 RBL1P28749 1068 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 UGP2Q16851 508 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 NADK2Q4G0N4 442 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 RCN3Q96D15 328 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CHST12Q9NRB3 414 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 NID2Q14112 1375 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 INPP4BO15327 924 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FGRP09769 529 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 LAMC2Q13753 1193 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 LRRN4Q8WUT4 740 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 KAT6AQ92794 2004 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DLG3Q92796 817 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 AGBL1Q96MI9 1066 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MBOAT7Q96N66 472 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PARVBQ9HBI1 364 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 FBXO40Q9UH90 709 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 A0A096LPK6 155 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 GJA8P48165 433 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DEFA1P59665 94 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DEFA3P59666 94 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TERB1Q8NA31 727 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 APBB2Q92870 758 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 COPG2Q9UBF2 871 aa15.5■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TPP1O14773 563 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TGDSO95455 350 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 EPHA3P29320 983 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MYL6P60660 151 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 INAQ16352 499 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 BMT2Q1RMZ1 405 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 NPNTQ6UXI9 565 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 SIK2Q9H0K1 926 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PTGES3LE9PB15 166 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 IRF6O14896 467 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PIGNO95427 931 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 APOC2P02655 101 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CETPP11597 493 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 KCNA2P16389 499 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 NAGLUP54802 743 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 PRKCEQ02156 737 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 MGAT5Q09328 741 aa15.49■□□□□ 0.07
CASC3-201ENST00000264645 CYP1B1Q16678 543 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms