RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 CCT5P48643 541 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LIG4P49917 911 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R2AP63151 447 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP24A1Q07973 514 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP3CAQ08209 521 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCY2Q08462 1091 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CALCOCO2Q13137 446 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GRM2Q14416 872 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MESDQ14696 234 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 STPG1Q5TH74 334 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ACAD10Q6JQN1 1059 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 BBOF1Q8ND07 529 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR7Q8TB68 274 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 P3H4Q92791 437 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNN1Q92952 543 aa7.39□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP2Q9H0W7 228 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RXFP1Q9HBX9 757 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB20Q9NX57 234 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 BPTFQ12830 3046 aa7.39□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 CARNS1A5YM72 827 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM150BA6NC51 233 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 THAP12O43422 761 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 GAS8O95995 478 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ADH1CP00326 375 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT14P02533 472 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 CYP11B1P15538 503 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 COMTP21964 271 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LSP1P33241 339 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RFC5P40937 340 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CCR3P51677 355 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 LIMK1P53667 647 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMARCE1-201ENST00000264640 PDCLQ13371 301 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R5DQ14738 602 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SURF1Q15526 300 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 UGCGQ16739 394 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 KCTD16Q68DU8 428 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP68Q76N32 757 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP14Q86W24 1093 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 JAMLQ86YT9 394 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf67Q8IYJ2 551 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD6BQ8N6M0 293 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL3Q969E4 200 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CENPTQ96BT3 561 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF26Q96DR7 871 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NELL2Q99435 816 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 SH2D3AQ9BRG2 576 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM175Q9BSA9 504 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH5Q9H2P9 285 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 RSAD1Q9HA92 442 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST12Q9NRB3 414 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NRBP2Q9NSY0 501 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNG4Q9UBN1 327 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 STK39Q9UEW8 545 aa7.38□□□□□ -1.23
SMARCE1-201ENST00000264640 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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