RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 AGAP11Q8TF27 550 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 SUSD3Q96L08 255 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 MSH2P43246 934 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1EQ12965 1108 aa27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 TEX28O15482 410 aa27.4■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT5Q92993 513 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL5Q96PQ7 755 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 NINJ2Q9NZG7 142 aa27.4■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 EP400NLQ6ZTU2 488 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL13Q8NEE6 735 aa27.39■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA11Q9UKX5 1188 aa27.39■■□□□ 1.98
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CAPNS1-201ENST00000246533 FITM2Q8N6M3 262 aa27.39■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD42Q8N9B4 389 aa27.39■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.39■■□□□ 1.971e-21■■■■■ 79.2
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CAPNS1-201ENST00000246533 TAF6P49848 677 aa27.38■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 E7ENQ6 273 aa27.37■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 SETDB1Q15047 1291 aa27.37■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNA3P51805 1871 aa27.36■■□□□ 1.97
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CAPNS1-201ENST00000246533 HPDLQ96IR7 371 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 PITPNM3Q9BZ71 974 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB8Q9UN66 801 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 TAC1P20366 129 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 CETN2P41208 172 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-201ENST00000246533 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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