RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227474.7

PUS3-201, Transcript of pseudouridylate synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUS3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3-201ENST00000227474 FSCN2O14926 492 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SLC22A3O75751 556 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CNMDO75829 334 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NEBLO76041 1014 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 COMTP21964 271 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NOS3P29474 1203 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PSMC4P43686 418 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 LIG4P49917 911 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 WNT7BP56706 349 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SLC26A5P58743 744 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 B2MP61769 119 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SP4Q02446 784 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NR6A1Q15406 480 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CYP1B1Q16678 543 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 DUPD1Q68J44 220 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 C11orf88Q6PI97 169 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 LRRC31Q6UY01 552 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SPATA24Q86W54 205 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 TMEM143Q96AN5 459 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 MIEF2Q96C03 454 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 FAM167AQ96KS9 214 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CGRRF1Q99675 332 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NUP85Q9BW27 656 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PPT2Q9UMR5 302 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ARID2Q68CP9 1835 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 LCTP09848 1927 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 MYH10P35580 1976 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 MYH11P35749 1972 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ABLIM1O14639 778 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ADCY3O60266 1144 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 B4GALT4O60513 344 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 AOC2O75106 756 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 DAB1O75553 588 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 VNN1O95497 513 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 HLA-DRAP01903 254 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 IVLP07476 585 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CHRNA3P32297 505 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 HNF1BP35680 557 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 HSD17B3P37058 310 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PTGIRP43119 386 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 BPIFB4P59827 614 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PPARDQ03181 441 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CUL2Q13617 745 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 STAT4Q14765 748 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 XKR5Q6UX68 686 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CEP97Q8IW35 865 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NUP93Q8N1F7 819 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PRELID2Q8N945 189 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 AVL9Q8NBF6 648 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 MOSPD2Q8NHP6 518 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 DEPTORQ8TB45 409 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 TRIM63Q969Q1 353 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ZNF653Q96CK0 615 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CMTM3Q96MX0 182 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CATSPER2Q96P56 530 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 CITED4Q96RK1 184 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 RUFY1Q96T51 708 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 RAB17Q9H0T7 212 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 SPON1Q9HCB6 807 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 GLRX2Q9NS18 164 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PCYOX1Q9UHG3 505 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PNMA3Q9UL41 463 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.05□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PTPRJQ12913 1337 aa9.04□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 TTC34A8MYJ7 566 aa9.04□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 STMND1H3BQB6 276 aa9.04□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 K7ERI5 159 aa9.04□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 DAPK3O43293 454 aa9.04□□□□□ -0.96
PUS3-201ENST00000227474 PHF2O75151 1096 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms