RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt35Q497I4 455 aa22.77■■□□□ 1.24
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IntS13Q8QZV7 732 aa22.77■■□□□ 1.24
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Phox2bO35690 314 aa22.73■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk4P30285 303 aa22.73■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HpseQ6YGZ1 535 aa22.73■■□□□ 1.23
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atxn1lP0C7T6 687 aa22.72■■□□□ 1.23
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hspa4lP48722 838 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CidecP56198 239 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Odr4Q4PJX1 447 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tlr11Q6R5P0 926 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1198Q7TR12 308 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrfn3Q8BLY3 626 aa22.72■■□□□ 1.23
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa22.72■■□□□ 1.23
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Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HgsQ99LI8 775 aa22.72■■□□□ 1.23
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