RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ferd3lQ923Z4 168 aa14.87□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf687Q9D2D7 1237 aa14.87□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr414E9Q5P8 317 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rpusd2Q149F1 553 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc24a2Q14BI1 711 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fgd2Q8BY35 655 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmed5Q9CXE7 229 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Chaf1bQ9D0N7 572 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ankef1Q9D2J7 775 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 MetP16056 1379 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Abi2P62484 446 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bbs1Q3V3N7 593 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clip4Q8CI96 704 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prpf39Q8K2Z2 665 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 B3galt6Q91Z92 325 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tnfaip8Q921Z5 198 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pou5f2Q9DAC9 329 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 AlbP07724 608 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 NfixP70257 488 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TraddQ3U0V2 310 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nt5c2Q3V1L4 560 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bcar1Q61140 874 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cep78Q6IRU7 790 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr392Q7TRX6 312 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Olfr293Q7TS10 336 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ube3cQ80U95 1083 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cdk17Q8K0D0 523 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sumf1Q8R0F3 372 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 GhdcQ99J23 532 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pds5aQ6A026 1332 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ripk2P58801 539 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ttc39dQ0VF76 604 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Shc3Q61120 474 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kcna4Q61423 654 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem270Q6UJB9 264 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 WhrnQ80VW5 918 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 GmppbQ8BTZ7 360 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Elmo3Q8BYZ7 720 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DmgdhQ9DBT9 869 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Igsf9bE9PZ19 1328 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fndc1E9Q043 1732 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfy1P10925 782 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Sesn1P58006 492 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dnajc5P60904 198 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 rp9P97762 213 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Itih2Q61703 946 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fig4Q91WF7 907 aa14.86□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Teddm2Q208S0 260 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tcf12Q61286 706 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Q8BGC1 442 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gtf2h3Q8VD76 309 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ninj2Q9JL89 143 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mup6A2AV72 179 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nfkb1P25799 971 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DbtP53395 482 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kct2Q8K201 259 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Spag16Q8K450 639 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Apba3O88888 571 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam91a1Q3UVG3 837 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TsnQ62348 228 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gja3Q64448 417 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Etnk1Q9D4V0 363 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp4a12bA2A974 508 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clcn3P51791 818 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pick1Q62083 416 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Phf8Q80TJ7 1023 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf569Q80W31 679 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 C2cd2lQ80X80 706 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Noc4lQ8BHY2 516 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem154Q8C4Q9 181 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Clk2O35491 499 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adam15O88839 864 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Slc30a5Q8R4H9 761 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Akr1c20Q8VC77 323 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam45aQ9D8N2 357 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Acsl4Q9QUJ7 711 aa14.85□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gcnt4E9Q649 455 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 HalP35492 657 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ntrk3Q6VNS1 825 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tmem161aQ8VCA6 480 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arhgef25Q9CWR0 618 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tssk3Q9D2E1 268 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rabl3Q9D4V7 236 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Oma1Q9D8H7 521 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fut8Q9WTS2 575 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bscl2Q9Z2E9 383 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nptx2O70340 429 aa14.84□□□□□ -0.03
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rtn2O70622 471 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms