RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 PARD3BQ8TEW8 1205 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 OLFM2O95897 454 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP17A1P05093 508 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 GBP1P32455 592 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 SEC13P55735 322 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf40Q86WS4 652 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.45■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.45■■□□□ 1.67
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CAPNS1-216ENST00000628306 AIPL1Q9NZN9 384 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXC1Q12948 553 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 DHCR24Q15392 516 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-216ENST00000628306 ALLCQ8N6M5 410 aa25.44■■□□□ 1.66
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