RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX28O15482 410 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CD48P09326 243 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP1B1Q16678 543 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP18Q8N392 663 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71BQ8TC56 605 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGVQ9NUD9 493 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQH9 124 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A8A6NNN8 435 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT10P13645 584 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MTMR3Q13615 1198 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PDK2Q15119 407 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM131BQ86XD5 332 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC185Q8N715 623 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 GIPC2Q8TF65 315 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MAFFQ9ULX9 164 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF2O75151 1096 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 F9P00740 461 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH6P55285 790 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY2Q08462 1091 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 NME3Q13232 169 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SHHQ15465 462 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CA9Q16790 459 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 C8orf74Q6P047 294 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM32Q8TC27 787 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO32Q969P5 355 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4F11Q9HBI6 524 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 OSER1Q9NX31 292 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 GMIPQ9P107 970 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf67F2Z3F1 127 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TJP3O95049 919 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL14O95715 111 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV3-25P01717 112 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CNPP09543 421 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYSL3Q14195 570 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYSL2Q16555 572 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TMC7Q7Z402 723 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TAC4Q86UU9 113 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 VSIG1Q86XK7 387 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL8Q8IYN2 117 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf80Q9BSJ5 609 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 DDIT4Q9NX09 232 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 COX16Q9P0S2 106 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FZD10Q9ULW2 581 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 IRAK3Q9Y616 596 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 GRXCR1A8MXD5 290 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF15O94989 841 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOGP15173 224 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF10Q12962 218 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KAZNQ674X7 775 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CALN1Q9BXU9 219 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC19Q9H756 370 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH18Q9HCL0 1135 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 AP4E1Q9UPM8 1137 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF1Q9Y548 306 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA3P32297 505 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCR3P49682 368 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 PSEN1P49768 467 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 AIF1P55008 147 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVFC1P60507 584 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT81Q14533 505 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 NTAN1Q96AB6 310 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF487B1APH4 448 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD51CO43502 376 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 IL4RP24394 825 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 L1CAMP32004 1257 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 GBP1P32455 592 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE3AQ05086 875 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PNKPQ96T60 521 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 TCF25Q9BQ70 676 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-215ENST00000628018 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.88■■□□□ 1.73
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