RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GAB3Q8WWW8 586 aa30.43■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TFAP2BQ92481 460 aa30.43■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FRYLO94915 3013 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 STC2O76061 302 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 DGKEP52429 567 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SPEM2Q0P670 501 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LCLAT1Q6UWP7 414 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF276Q8N554 614 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ALLCQ8N6M5 410 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MLKLQ8NB16 471 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CLSTN2Q9H4D0 955 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MARCH2Q9P0N8 246 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR35Q9P2L0 1181 aa30.42■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KRT5P13647 590 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LCP1P13796 627 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 BRD2P25440 801 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF4P43489 277 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GCNT1Q02742 428 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 EMC10Q5UCC4 262 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 BHMTQ93088 406 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MMP17Q9ULZ9 603 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC12A8A0AV02 714 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 M0QYV0 167 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CALCAP01258 141 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TYRP14679 529 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS7P49802 495 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 C10orf76Q5T2E6 689 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PM20D1Q6GTS8 502 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 GRAMD4Q6IC98 578 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF139Q8WU17 664 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 DCLK3Q9C098 648 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF510Q9Y2H8 683 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SPTBN4Q9H254 2564 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 STILQ15468 1287 aa30.39■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CNGA2Q16280 664 aa30.39■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ANO7Q6IWH7 933 aa30.39■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CRACR2AQ9BSW2 395 aa30.39■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP30.39■■■□□ 2.46
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0A0MRY4 1105 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 EOGTQ5NDL2 527 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 Q6ZNB5 142 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PHTF2Q8N3S3 785 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 IL17RCQ8NAC3 791 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KCTD13Q8WZ19 329 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 EDEM1Q92611 657 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PIK3R2O00459 728 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM24O15164 1050 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH1A2O94788 518 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CRY1Q16526 586 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 BSPRYQ5W0U4 402 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KBTBD6Q86V97 674 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TERB1Q8NA31 727 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RMDN1Q96DB5 314 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KREMEN1Q96MU8 473 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TPSD1Q9BZJ3 242 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PARD6AQ9NPB6 346 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PLK2Q9NYY3 685 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MARK1Q9P0L2 795 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 EBF1Q9UH73 591 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MYOFQ9NZM1 2061 aa30.37■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SGK1O00141 431 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KLKB1P03952 638 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 LMNB2Q03252 620 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PKDCCQ504Y2 493 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PMF1Q6P1K2 205 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DENND1CQ8IV53 801 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZSWIM1Q9BR11 485 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CNGB3Q9NQW8 809 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 INVSQ9Y283 1065 aa30.36■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 YJEFN3A6XGL0 299 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 E7ENQ6 273 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CACNG3O60359 315 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CHKAP35790 457 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MFAP3P55082 362 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC35F5Q8WV83 523 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MED15Q96RN5 788 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DCLK1O15075 740 aa30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms