RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 VAMP7P51809 220 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 TPGS1Q6ZTW0 290 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CHPFQ8IZ52 775 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CYFIP2Q96F07 1278 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.87e-8■■■■■ 186.3
PTPRF-216ENST00000617451 USP25Q9UHP3 1055 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA1EQ15878 2313 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 PCNX2A6NKB5 2137 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GVL5 298 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQH9 124 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 PRRT4C9JH25 899 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CALUO43852 315 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF9P0C862 333 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 RARGP13631 454 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 PFKFB1P16118 471 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CMA1P23946 247 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 DUOXA1Q1HG43 343 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 SDE2Q6IQ49 451 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 HSCBQ8IWL3 235 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB119Q8N690 84 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CEP76Q8TAP6 659 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 GABRG3Q99928 467 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 CYP3A43Q9HB55 503 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 DNMT3LQ9UJW3 386 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A14Q9UN76 642 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRF-216ENST00000617451 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF217O75362 1048 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CFIP05156 583 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFV2P19404 249 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SPINK2P20155 84 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G4AP47712 749 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZNB5 142 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT5Q9UKK9 219 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 HPSEQ9Y251 543 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 AKAP13Q12802 2813 aa26.26■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 MDM4O15151 490 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CISD3P0C7P0 127 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 GCLMP48507 274 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KIF11P52732 1056 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF33AQ06730 810 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3BQ13214 749 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NFIL3Q16649 462 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 C10orf120Q5SQS8 335 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF276Q8N554 614 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TAS1R2Q8TE23 839 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SLC32A1Q9H598 525 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CAPN10Q9HC96 672 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 UPK3BL1B0FP48 263 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 UPK3BL2E5RIL1 263 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CILPO75339 1184 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KIF20AO95235 890 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINF2P08697 491 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM49P0CI25 452 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM49CP0CI26 452 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NR2F2P24468 414 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 DGKGP49619 791 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PPP3CAQ08209 521 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SCD5Q86SK9 330 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PIP4P1Q86T03 277 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ADAM33Q9BZ11 813 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 FSCN3Q9NQT6 498 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 NAGPAQ9UK23 515 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO10Q9UK96 956 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CEP192Q8TEP8 1941 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SPEGQ15772 3267 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 PSEN1P49768 467 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 ENPEPQ07075 957 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 RABEPKQ7Z6M1 372 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 TADA2BQ86TJ2 420 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 BHMTQ93088 406 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 P2RY11Q96G91 374 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 SCNM1Q9BWG6 230 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP16Q9BY84 665 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 CYP8B1Q9UNU6 501 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 USP3Q9Y6I4 520 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 GFRA2O00451 464 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRF-216ENST00000617451 STC2O76061 302 aa26.22■■□□□ 1.79
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