RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	EPAS1	Q99814	870 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SPON2	Q9BUD6	331 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	IRF1	P10914	325 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	DSE	Q9UL01	958 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	INHBA	P08476	426 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CCL5	P13501	91 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	STX2	P32856	288 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CCT5	P48643	541 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CAP1	Q01518	475 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	GBE1	Q04446	702 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PPM1N	Q8N819	430 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	LGMN	Q99538	433 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	RASA4B	C9J798	803 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MDM4	O15151	490 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	RASA4	O43374	803 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ATP9B	O43861	1147 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	BNIP3L	O60238	219 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SPAG7	O75391	227 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ACR	P10323	421 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ATP5D	P30049	168 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MATK	P42679	507 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	COPS2	P61201	443 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	IRX4	P78413	519 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	GRIN2D	O15399	1336 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	EBAG9	O00559	213 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	NOS2	P35228	1153 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	MSH2	P43246	934 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PDK2	Q15119	407 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	LRRC38	Q5VT99	294 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	NRP1	O14786	923 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ADAM17	P78536	824 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CAV1	Q03135	178 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	DUSP4	Q13115	394 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	RUBCN	Q92622	972 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	APOC2	P02655	101 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	GDF10	P55107	478 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	IKBKE	Q14164	716 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-222	ENST00000592763	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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