RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NMUR1Q9HB89 426 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK13Q9UKR3 277 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SCML2Q9UQR0 700 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF217O75362 1048 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ASS1P00966 412 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM200BP0CF97 657 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ME1P48163 572 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM193AP78312 1265 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SDE2Q6IQ49 451 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIML1Q8N9V2 468 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM174Q8WUU8 243 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 BHMTQ93088 406 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY11Q96G91 374 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.921e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTAD1Q9UHV2 236 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SPEGQ15772 3267 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 OPHN1O60890 802 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 NR3C1P04150 777 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8FQ08AF8 430 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf220Q5T0J3 134 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RABEPKQ7Z6M1 372 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF4BQ92750 862 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQH9 124 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGAP33O14559 1287 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CISD3P0C7P0 127 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ACO1P21399 889 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PIK3CAP42336 1068 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 DGKGP49619 791 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZNB5 142 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC2Q8TDI7 906 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 BACH2Q9BYV9 841 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC1Q9NV70 894 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PLK2Q9NYY3 685 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MSRB2Q9Y3D2 182 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF2RP11717 2491 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 WASH3PC4AMC7 463 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DRAP01903 254 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 RARGP13631 454 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 CD59P13987 128 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 INCA1Q0VD86 236 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PAGE5Q96GU1 130 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQD8 194 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SLFN14P0C7P3 912 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP135Q66GS9 1140 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CYFIP2Q96F07 1278 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 DNMT3LQ9UJW3 386 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ZZEF1O43149 2961 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PDXKO00764 312 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 IKBKBO14920 756 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 STC2O76061 302 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 F13A1P00488 732 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G4AP47712 749 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf120Q5SQS8 335 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SCD5Q86SK9 330 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PNPLA8Q9NP80 782 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO10Q9UK96 956 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 GFRA2O00451 464 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS2O75306 463 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF11P52732 1056 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG6Q3KR16 790 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 RGL4Q8IZJ4 473 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5C1AQ9BXI3 368 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 NAGPAQ9UK23 515 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 STON1Q9Y6Q2 735 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP13Q12802 2813 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB3O75712 270 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 KLKB1P03952 638 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 SYPP08247 313 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-211ENST00000590874 MAOBP27338 520 aa26.98■■□□□ 1.91
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