RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 DNM3Q9UQ16 869 aa8.03□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.02□□□□□ -1.12
EFTUD2-218ENST00000590367 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 LAMA4Q16363 1823 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CLOCKO15516 846 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ASNA1O43681 348 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CREB1P16220 341 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CA4P22748 312 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ALDH1A3P47895 512 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 STK11Q15831 433 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 DGKDQ16760 1214 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 AFG1LQ8WV93 481 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 EGLN2Q96KS0 407 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ACAP3Q96P50 834 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SP140LQ9H930 580 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 FANCEQ9HB96 536 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CFL2Q9Y281 166 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 GGPS1O95749 300 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT8P05787 483 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PSMC3P17980 439 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SERPINB1P30740 379 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 NPEPPSP55786 919 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 AMPD3Q01432 767 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SNAPC2Q13487 334 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 COG2Q14746 738 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 GRM4Q14833 912 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TMED2Q15363 201 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TLR1Q15399 786 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ANO4Q32M45 955 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PDPRQ8NCN5 879 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TBCKQ8TEA7 893 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SHISA4Q96DD7 197 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 YME1L1Q96TA2 773 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF186Q9NXI6 227 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 USP17L5A8MUK1 530 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 C8BP07358 591 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC10A3P09131 477 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 H2AFZP0C0S5 128 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 OR52Z1P0C646 297 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 NAGAP17050 411 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ALDH3B2P48448 385 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 OLR1P78380 273 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CAV1Q03135 178 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TRPC3Q13507 836 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MPP2Q14168 576 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.131e-7■■■■□ 23.6
EFTUD2-218ENST00000590367 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 H2AFVQ71UI9 128 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 NEK8Q86SG6 692 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 IFNL1Q8IU54 200 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 RAB34Q9BZG1 259 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PCDH12Q9NPG4 1184 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 TBK1Q9UHD2 729 aa8.02□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 FCHO1O14526 889 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MTSS1O43312 755 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF254O75437 659 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 POLR2MP0CAP2 368 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MCF2P10911 925 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT15P19012 456 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PKLRP30613 574 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PRKCQQ04759 706 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 KRT80Q6KB66 452 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
EFTUD2-218ENST00000590367 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms