RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ERMARDQ5T6L9 678 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 LILRA6Q6PI73 481 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC149Q6ZUS6 474 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP32.34■■■□□ 2.777e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF276Q8N554 614 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 EDEM1Q92611 657 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MYRFLQ96LU7 910 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM33Q9BZ11 813 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MSRAQ9UJ68 235 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 INSL5Q9Y5Q6 135 aa32.34■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQH9 124 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF10Q12962 218 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 TFDP3Q5H9I0 405 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MSANTD2Q6P1R3 559 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP7D3Q8IWC1 876 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR152Q8TDT2 470 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 GIPC2Q8TF65 315 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF139Q8WU17 664 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 SMOC2Q9H3U7 446 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 MTUS1Q9ULD2 1270 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB3Q9Y575 518 aa32.33■■■□□ 2.77
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRD1A4D1F6 860 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BNC9 293 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CTIFO43310 598 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TGM5O43548 720 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF15O94989 841 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-25P01717 112 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RALAP11233 206 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KDELR1P24390 212 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KLRC2P26717 231 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHB3P54753 998 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SMTNL2Q2TAL5 461 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ITIH5Q86UX2 942 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NTAN1Q96AB6 310 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 OSBPL8Q9BZF1 889 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NMUR1Q9HB89 426 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GMIPQ9P107 970 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXW11Q9UKB1 542 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa32.32■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF487B1APH4 448 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP3CCP48454 512 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNT1Q5JUK3 1230 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPP4Q5VZY2 271 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD6Q8NC69 237 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM204AQ9H8W3 233 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DDIT4Q9NX09 232 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 KRIT1O00522 736 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJB1P25685 340 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MTMR3Q13615 1198 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TAZQ16635 292 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB6CQ53S08 254 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX30Q5VWJ9 437 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 AADACL2Q6P093 401 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MMGT1Q8N4V1 131 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71BQ8TC56 605 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RAPGEF5Q92565 580 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 UBXN4Q92575 508 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PBX4Q9BYU1 374 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB6CQ9H0N0 254 aa32.3■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GLUD1P00367 558 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN2BP42772 138 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 NME3Q13232 169 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GPM6BQ13491 265 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF12Q16514 161 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 DPYSL2Q16555 572 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL13BQ3SXY8 428 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD7Q6UXD7 560 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 STKLD1Q8NE28 680 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPH1Q92598 858 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB11Q96P15 392 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 LMAN2LQ9H0V9 348 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 PIGVQ9NUD9 493 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 GRM6O15303 877 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 CXCR3P49682 368 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSEP51690 589 aa32.29■■■□□ 2.76
CAPNS1-206ENST00000588815 TWF1Q12792 350 aa32.29■■■□□ 2.76
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