RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR5O60602 858 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 HLA-EP13747 358 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 TNNI1P19237 187 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 TPMTP51580 245 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 HTR3DQ70Z44 454 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF605Q86T29 641 aa23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM124AQ86V42 546 aa23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM9Q9C026 710 aa23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 STK17AQ9UEE5 414 aa23.03■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 KCNJ18B7U540 433 aa23.02■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 TRPC3Q13507 836 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK2BQ13554 666 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 SNX30Q5VWJ9 437 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 DHRS13Q6UX07 377 aa23.02■■□□□ 1.28
CAPNS1-205ENST00000588780 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.02■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 NUP58Q9BVL2 599 aa23.02■■□□□ 1.28
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CAPNS1-205ENST00000588780 TEAD4Q15561 434 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM35AQ86V20 835 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 RDH13Q8NBN7 331 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 UCMAQ8WVF2 138 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 MARK1Q9P0L2 795 aa23.01■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 KNL1Q8NG31 2342 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 PLK4O00444 970 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 AP1G2O75843 785 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 DKK1O94907 266 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 TBX18O95935 607 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM163BP0C2L3 166 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 TXLNAP40222 546 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 GRK6P43250 576 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CDH8P55286 799 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 KIF19Q2TAC6 998 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa23■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 SNX11Q9Y5W9 270 aa23■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QL1O75973 258 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CISD3P0C7P0 127 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G2AP14555 144 aa22.99■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 USP49Q70CQ1 688 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.99■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT82Q9NSB4 513 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 COMMD8Q9NX08 183 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 AK5Q9Y6K8 562 aa22.99■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNK3O14649 394 aa22.98■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 IL12RB1P42701 662 aa22.98■■□□□ 1.27
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CAPNS1-205ENST00000588780 NPC1O15118 1278 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 CCT8P50990 548 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF132P52740 706 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 ARID5AQ03989 594 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 TNIP3Q96KP6 325 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 IL37Q9NZH6 218 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.97■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 HNF1BP35680 557 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 PGFP49763 221 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 MYL6P60660 151 aa22.96■■□□□ 1.27
CAPNS1-205ENST00000588780 IL9RQ01113 521 aa22.96■■□□□ 1.27
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