RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 SDC4P31431 198 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 NR2C2P49116 596 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 BCAT1P54687 386 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 IL9RQ01113 521 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ROR1Q01973 937 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 DPYSL3Q14195 570 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 KRT81Q14533 505 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SV2CQ496J9 727 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC14Q49A88 953 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 EFHC2Q5JST6 749 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf57Q5W0N0 161 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC26A9Q7LBE3 791 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TRABD2AQ86V40 505 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 EMC1Q8N766 993 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SPATA18Q8TC71 538 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 FBF1Q8TES7 1133 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CPT1BQ92523 772 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CCT6BQ92526 530 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TNIP3Q96KP6 325 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 C9orf72Q96LT7 481 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF157Q96PX1 679 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SETD4Q9NVD3 440 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PAK5Q9P286 719 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CLUHO75153 1309 aa7.49□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RASA4BC9J798 803 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RASA4O43374 803 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SNX3O60493 162 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RECQL4O94761 1208 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SUN1O94901 812 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ZWINTO95229 277 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 IFNB1P01574 187 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 RBP3P10745 1247 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CYP2C9P11712 490 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PAX3P23760 479 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 STX2P32856 288 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CDH6P55285 790 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC8A3P57103 927 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SPARCL1Q14515 664 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SNX17Q15036 470 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 MTFR1Q15390 333 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 DPYSL2Q16555 572 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 KIZQ2M2Z5 673 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SMTNL2Q2TAL5 461 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC38Q502W7 563 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 KCNT1Q5JUK3 1230 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TAF2Q6P1X5 1199 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 STRADAQ7RTN6 431 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC30AQ86WT1 665 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 MCUQ8NE86 351 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 UBA3Q8TBC4 463 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 PYROXD1Q8WU10 500 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.48□□□□□ -1.21
EFTUD2-208ENST00000587914 HSPH1Q92598 858 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms