RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM25Q86YD3 366 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 FAM114A1Q8IWE2 563 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RNF139Q8WU17 664 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 WBP2Q969T9 261 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ACDQ96AP0 544 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 USP3Q9Y6I4 520 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SLC12A8A0AV02 714 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 K7ESF4 209 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 M0QYV0 167 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TULP2O00295 520 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 O00370 1275 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PIK3R2O00459 728 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LILRB5O75023 590 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CALCAP01258 141 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SETSIPP0DME0 302 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TDGF1P13385 188 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CNR2P34972 360 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GRIA2P42262 883 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RGS7P49802 495 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MFAP3P55082 362 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GCNT1Q02742 428 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KDSRQ06136 332 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ADIGQ0VDE8 80 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 STILQ15468 1287 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CNGA2Q16280 664 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GBP6Q6ZN66 633 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DCLK2Q8N568 766 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LMO3Q8TAP4 145 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TFAP2BQ92481 460 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GOLGA1Q92805 767 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 NELL1Q92832 810 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BHMTQ93088 406 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 FAM81BQ96LP2 452 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HHIPQ96QV1 700 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BBS2Q9BXC9 721 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LMBRD1Q9NUN5 540 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DEC1Q9P2X7 70 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 K7EQS6 105 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 THAP12O43422 761 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MED7O43513 233 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HRO43593 1189 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KAT7O95251 611 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SLC9A1P19634 815 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 HOXC13P31276 330 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CHKAP35790 457 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DGKEP52429 567 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 DMC1Q14565 340 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GAB4Q2WGN9 574 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 RAB41Q5JT25 222 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 GJB7Q6PEY0 223 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 SYT13Q7L8C5 426 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 C12orf40Q86WS4 652 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 UBR7Q8N806 425 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 USP33Q8TEY7 942 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRM-214ENST00000583153 EDEM1Q92611 657 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms