RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MGAT3Q09327 533 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDK4Q16654 411 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCYL2Q6P3W7 929 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BBS12Q6ZW61 710 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK32AQ8WU08 396 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SENP1Q9P0U3 644 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SGK1O00141 431 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SDC4P31431 198 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDH6P55285 790 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX16P57768 344 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASA2Q15283 850 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAZQ16635 292 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C4orf33Q8N1A6 199 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOP6BLQ8N6T0 577 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBF1Q8TES7 1133 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C10orf88Q9H8K7 445 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SHOC2Q9UQ13 582 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TYROBPO43914 113 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFNB1P01574 187 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITGAVP06756 1048 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMRN1Q13201 1228 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC1A5Q15758 541 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HACE1Q8IYU2 909 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBED8Q8IZ13 594 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM172AQ8WUF8 416 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNIP3Q96KP6 325 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMC6Q96SB8 1091 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS37BQ9H9H4 285 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USH1CQ9Y6N9 552 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EDF1O60869 148 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT15P19012 456 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WARSP23381 471 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NKX3-2P78367 333 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SP3Q02447 781 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WSCD1Q658N2 575 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDH9Q9HC56 1237 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHST12Q9NRB3 414 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIOSQ9NXC5 875 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPYSL4O14531 572 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR182O15218 404 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CD52P31358 61 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAPN12Q6ZSI9 719 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF169Q8NCN4 708 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERP27Q96DN0 273 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRMDAQ9H2I8 198 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC24A2Q9UI40 661 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PPM1 405 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 THP07101 528 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPX6P59796 221 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CENPUQ71F23 418 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARL5CA6NH57 179 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCNN1GP51170 649 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOGQ13253 232 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFHC2Q5JST6 749 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC13Q8NBP0 860 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIEF2Q96C03 454 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RSAD1Q9HA92 442 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPCSQ9HAB8 311 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PADI3Q9ULW8 664 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLUHO75153 1309 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLDN5O00501 218 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BANF1O75531 89 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WFS1O76024 890 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLCNKBP51801 687 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARP6Q2NL67 630 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C10orf82Q8WW14 230 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF3CO14782 793 aa25.01■■□□□ 1.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CA4P22748 312 aa25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms